En 1989 s’est tenue la première réunion de 23 académies en région, qui allaient constituer formellement la CNA en 1994. Ainsi s’est concrétisée l’idée du bâtonnier Albert Brunois, alors président de l’Académie des Sciences Morales et Politiques, et du médecin-général Edmond Reboul, président de l’Académie des Sciences, Belles-Lettres et Arts de Lyon. La CNA est placée sous l’égide de l’Institut de France.

Monsieur le Chancelier Xavier Darcos y est représenté par Monsieur Bernard Bourgeois, président d’honneur.

A ce jour, la CNA fédère 33 Académies. La dernière affiliation date de 2019 et concerne l’Académie de Reims.

Les Académies candidates doivent répondre à 5 critères : l’ancienneté, la pluridisciplinarité, la limitation du nombre de membres, la procédure d’accueil des nouveaux membres par élection, les travaux et les publications périodiques.